Trước năm 2002, quy định ngành tài chính Đức được thực hiện bởi ba cơ quan độc lập. Với việc thông qua Đạo luật tích hợp và dịch vụ tài chính, BaFin được thành lập vào tháng 5/2002. Mục đích của việc sáp nhập Đạo luật và ba cơ quan là tạo ra một cơ quan quản lý tài chính tích hợp bao gồm tất cả các thị trường tài chính. Các tổ chức kết hợp là Văn phòng Điều tiết Ngân hàng Liên bang, Văn phòng Điều tiết Chứng khoán Liên bang và Văn phòng Điều tiết Bảo hiểm Liên bang. Với việc thông qua Đạo luật Ngân hàng 2003, BaFin đã nhận thêm trách nhiệm, với mục đích tăng cường bảo vệ khách hàng và nâng cao uy tín của hệ thống tài chính Đức.Các quyền bổ sung bao gồm chịu trách nhiệm giám sát các tổ chức tài chính và thu thập thông tin chi tiết về họ. Trách nhiệm đặc biệt này được chia sẻ với Bundesbank. Hiện tại, BaFin đang trong giai đoạn chuyển tiếp khi Ngân hàng Trung ương châu Âu đảm nhận trách nhiệm giám sát ngành ngân hàng.